不是。日常可见的小番茄其果实颜色十分丰富，有红色、粉色、黄色及橙色，其中以红色栽培居多，是不同品种的番茄杂交培育来的，并不是染色所得，假如吃到的小番茄外面红彤彤，但里面还是绿色，这也不属于染色现象，可能跟小番茄还未熟透或种植条件不好有关。
小番茄是不是转基因：不是转基因食品。转基因食物的定义是运用科学手段从某种生物中提取所需要的基因，将其转入另一种生物中，使与另一种生物的基因进行重组，从而产生特定的具有优良遗传性状的物种，而小番茄并不是通过人为改变基因获得的品种，它的出现在很早以前就有了，只是当时的产量不好，而且主要是以观赏种植，后来随着种植技术增强，产量提高，才逐渐发展为食品食用。
