手术拔甲：这种方法创面大，易感染、出血。手术后一般会感觉较疼痛，由于“治标不治本”，一般治疗效果不太理想，容易重新感染复发，患有心脏病、高血压、糖尿病等的患者，不宜进行手术治疗。
内服药物：单纯服用抗真菌药物有一定疗效，且方便。常用药物为伊曲康唑，每次2粒，每日2次，餐后立即服用，服药1周、停3周为1个疗程，指甲病变通常两个疗程，趾甲病变通常需要3个疗程，治愈率达80%以上。但因为这类药必须达到真菌所寄生的甲板处才能发挥抗菌作用，而且在水中的溶解度低且慢，吸收代谢又很快，所以用药量大、用药时间长。
外用疗法：根据药剂不同，主要有浸泡、局部涂药和封包削治等方法。治疗时需配合去除病甲，安全、无痛苦、无副作用。只要药剂选用得当，效果较理想。总之，灰指甲顽固难治，临床上需根据患者的病情轻重、患者的年龄、机体的状况、是否伴有系统性疾病等具体分析，有时需几种方法并用才能取得较好的疗效。
