1、清道夫喜欢以鱼缸里的残食、污物为食，可以买一些清道夫，放在水中可以起到净化水质的作用。
2、可以利用虹吸原理进行清理鱼缸底部的粪便，找一根粗细合适、两头均可以出水的软管，装满水后按压住出水口，将一端伸入水底，将两端出水口松开，即可让鱼缸底部的粪便吸出。
3、生物方法，在鱼缸底部铺上底砂，主要是大理石、黑晶沙、河沙或仙土等，然后种植一定量的水生植物，在鱼类放养的密度不是很大的情况下，底砂和水草可以沉淀吸附鱼类的排泄物，水环境中的有益菌可以分解掉鱼类排泄物，水草也可再次吸收利用有益菌的分解产物。如果养殖密度比较大，建议结合过滤的方法。海绵过滤器，海绵在进行少量的物理吸附过滤的情况下，还是可以为有益菌提供了栖息的场所，分解水中的有机物，适合喜欢安静的鱼类，低密度的饲养。
