1、挂藏。用网兜或废旧的尼龙袜洗净晾干，把洋葱装入其中，用绳扎紧口，挂于阴暗干燥通风处保存，可防止洋葱过早发芽。但是还是建议一次性不要购买太多，最好是两天内能吃完，久存洋葱的营养价值会大打折扣。
2、坯藏。这种方法只限于少量贮藏，把充分晒干的好洋葱头混入细沙土和成泥，制成2.5～5公斤重的土坯，晒干后堆在通风干燥的地方，注意防雨防潮。天冷时防冻，发现土坯干裂时，及时用潮土填补裂缝。
3、垛藏。选择干燥通风的地方，用圆木或石块垫起高30厘米左右、宽1.6米左右的垛底，把充分晒干的洋葱辫或把，堆成1～1.6米高的垛，上盖3～4层席子，四周围2层席子，用绳子横竖绑紧，防止日晒雨淋，保持干燥，垛后封席初期，倒1～2次，每次下雨后都要检查一下，如有漏水晒干后再盖好席子。天冷时加盖草帘保温。寒冷地区，当气温降到零度以下时，拆垛搬到空屋或仓库里继续贮藏，温度保持在-2～3℃。上市前放在0～2℃温度下解冻。
4、切开冷藏。想要冷藏已经使用一半的洋葱，除了用保鲜膜将切面包覆后，放入冰箱冷藏之外，不妨先全部切成方便烹饪的大小，加入适量的盐混合均匀，再放入保鲜容器中密封冷藏，料理时便能直接使用，非常方便。洋葱切开后，营养素就会开始流失，氧化的速度非常快，可以使用盐稍微腌渍，留住洋葱的风味和品质。
5、切末冷冻。洋葱切丝或切末，若过程有沾到水可以用厨房纸巾把洋葱稍微压干，再装入保鲜袋中铺平、压出袋内空气后密封，贴上处理日期的标签后送入冷冻库。料理前不必解冻便能使用，且冷冻后的洋葱因为纤维遭到破坏，很快就能软化、煮熟。
洋葱本是比较耐保存的蔬菜，但如果保存的方法不当，也是很容易造成发芽的问题，发了芽的乃至长出青苗的洋葱，虽然不会产生有害人体的物质仍可以吃，但是，洋葱发芽后营养价值会下降而且味道会较辣。
