病因治疗（1）抗感染治疗 根据不同病因，选用相应的抗生素。（2）其他 如乳糖不耐受症不宜用乳制品，成人乳糜泻应禁食麦类制品。慢性胰腺炎可补充多种消化酶。药物相关性腹泻应立即停用有关药物。
对症治疗（1）一般治疗 纠正水、电解质、酸碱平衡紊乱和营养失衡。酌情补充液体，补充维生素、氨基酸、脂肪乳剂等营养物质。（2）黏膜保护剂 双八面体蒙脱石、硫糖铝等。（3）微生态制剂 如双歧杆菌可以调节肠道菌群。（4）止泻剂 根据具体情况选用相应止泻剂。（5）其他 654-2、溴丙胺太林、阿托品等具解痉作用，但青光眼、前列腺肥大者、严重炎症性肠病患者慎用。
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