第一步：目前来说激光就可以根治，因为病毒只是局限于软疣局部，一般通过激光去除软疣之后，病毒也去除了，既然已经做了激光，主要不要沾水，等到痂壳脱落后就好了。
第二步：在无菌情况下，用小镊子或止血钳将软疣夹破，挤出其内容物，或直接拔除较小的疣体，然后涂以5%碘酊或纯液体石碳酸或33%三氯醋酸(阴囊部损害禁用碘酊)，同时压迫止血。
第三步：将损害中的软疣小体用小镊子夹住疣体，将之挤出或挑出，然后点入浓石炭酸或三氯醋酸，并压迫止血。亦可用刮匙刮除，外涂2%碘酒。或0。1%维甲酸酒精局部涂搽。其他，可用电干燥，液氮或干冰冷冻，巨大疣可手术切除。
