名侦探柯南最新主线剧情共有30余篇：
走投无路的名侦探：连续两大杀人事件，小兰第二次怀疑柯南的身份，工藤优作和工藤有希子出现，有希子演出电视剧《危险女警物语》柯南差点被小兰识破，群马县山村刑事初登场。浪花连续杀人事件：沼渊已一郎登场，后来柯南得知他只是组织里的小角色，是组织培养杀手的失败作品。远山和叶初登场。黑暗之中的死角：新出智明登场，妃英理最后也出现。这是真正的新出智明在345集三方对决前唯一的一次出场。为保护无辜的女佣，警方修改的了案件的纪录，隐瞒了真实的作案手法，这一点只有真正的新出智明知道，而后来假扮新出的贝尔摩德只通过偷来的警方笔录知道了伪造的案情，所以这一点日后也被朱蒂用来指证贝尔摩德假扮新出智明。
