纳豆有苦味还能吃。一般而言，自制新鲜纳豆可密封后保存至冰箱冷冻层一周左右，但是如遇冬季或夏季，情况就随季节而变化，新鲜纳豆最好趁着新鲜尽早食用，否则纳豆中的很多活性成分会失效，有些作用功效就显现不出来了。
纳豆激酶不耐热，加热到70℃活性就消失了。所以生吃效果最好。为了保持它有益于心血管的鲜明健康特色，肯定也不能在里面加入大量油脂，或者配合大量动物性食品。纳豆的保质期为一周，它在冰箱内低温保存过程中，还在进行着缓慢的低温熟成发酵，纳豆激酶和维生素K2也在不断增加。但保质期过后虽然也能吃，只是纳豆菌为了生存不断分解蛋白质，其结果臭味逐渐增加。食用纳豆1小时至12小时之间纳豆激酶发挥溶解血栓的功能。而据统计脑梗塞、心肌梗塞等各种血栓病，发病时间多为清晨及星期一。因此每晚或星期日晚餐吃效果最好。
