会影响的。
存储数据交换完后，即刻要将U盘取下来，不要把U盘当硬盘使用，同时尽量不要长时间打开U盘，读取U盘中的数据，更不能长期插在电脑上。这是因为：
1、U盘是用来临时存储交换数据的，在设计上它不像硬盘装在主机中长时间开着使用，U盘没有散热措施,插在电脑上会产生较大的热量，时间越长热量越高,轻则缩短其使用寿命，重则被烧毁。
2、U盘插在电脑上除耗电处，还占用系统资源，影响运行速度。
3、插在电脑上容易受到木马病毒攻击，使用休眠侍机也容易丢失U盘中的文件。
4、插在电脑上开关机要对它进行检测，造成开关机缓慢，有时还会出现不能开机、关机着题。
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