亚甲基蓝在水里一般24小时失效。亚甲基蓝为深绿色青铜光泽结晶或粉末，可溶于水和乙醇，不溶于醚类。亚甲基蓝在空气中较稳定，其水溶液呈碱性，有毒。亚甲基蓝广泛应用于化学指示剂、染料、生物染色剂和药物等方面。
亚甲基蓝可以治疗鱼的一些疾病，但用药一定要控制好用量，如果浓度过高会形成药害，不仅不能起到治疗的效果，反而会对鱼的健康产生危害。
在化学实验中，分析纯亚甲基蓝可用作化学试剂中的吸附指示剂，也可用以沉淀高氯酸盐和铼酸盐，催化光度测定硒和钼等。
亚甲蓝还具有氧化性，可以氧化一些还原性较强的物质，自身被还原成无色的还原态亚甲蓝。可以被一些氧化性物质，如空气中的氧氧化，又生成氧化态的蓝色亚甲蓝。
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