卷烟厂和烟草局的区别是：
第一，卷烟厂是工业企业，而烟草局则是商业企业。
第二，卷烟厂生产烟，但是不能卖烟（卖烟就违法）；而专卖局则负责销售烟。
第三，卷烟厂只能把自己生产的烟以调拨价卖给烟草局，烟草局则是把卷烟批发给广大个体零售户，然后再卖到消费者手中，这两者之间并不是竞争关系，而是利益调整的关系。
第四，消费者不能直接从烟草局买烟，更不能到烟厂直接买烟。
第五，烟草局把农民手中的烟叶卖给烟厂，而烟厂不允许直接去农民手里购买烟叶。
第六，烟厂不一定每个地方都有，而烟草局几乎到处都有。
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