TPP在ATP的存在下由硫胺素焦磷酸激酶催化维生素B1生成，即维生素B1的活性衍生物是焦磷酸硫胺素（TPP）。由维生素B1在体内（如脑、肝等组织内）转变而成，是重要的酮酸如α-酮戊二酸氧化脱羧酶系的辅酶。其分子的重要特点是它的噻唑环上氮原子与硫原子之间的碳原子与通常所见的CH基团相比，表现出更强的酸性，它可离子化生成负碳离子，后者容易接受a-酮酸或酮糖的的羰基，而带正电荷的氮原子作为一个电子库（electionsink）对于稳定负碳离子以及a-酮酸的脱羧作用起重要作用，由于这些酶对于糖代谢具有十分重要的作用，故与糖的分解供能过程关系密切。
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