1、自酿酒容易滋生有害细菌：细菌广泛存在于自然环境中，很难完全杜绝。在自酿白米酒过程中，也是极有可能存在细菌的。是否会对人体产生危害，具体要看存在的细菌是什么，有多少？如果不是致病菌，通常不会有什么危害。如果是致病菌，且达到危害水平，那么就可能对人体产生危害。 实际上，如果灭菌不彻底，或者操作不规范，很有可能混入一些对人体有害的致病菌。
2、自酿酒容易甲醇超标：植物组织在发酵过程中，甲醇的产生几乎是不可避免的。因为，植物细胞壁中含有果胶，其本质是半乳糖醛酸聚糖，其侧链可被酯化，酯化的果胶在果胶酶作用下会生成甲醇。所以，白米酒发酵过程中的确会产生甲醇，不论是自酿还是工业化生产都会产生。
