得了自身免疫性脑炎有一部分患者会死亡，而且死亡率不低，达到30%以上，所以对于自身免疫性脑炎要积极的给予治疗，要尽快的明确诊断。明确诊断以后要给予免疫抑制剂药物，包括免疫球蛋白和血浆置换治疗，可以控制自身免疫性脑炎的发展。
可以给予一些营养神经的药物，促自身免疫性脑炎的恢复，同时也可以给予大剂量激素冲击治疗，可以通过免疫调节的治疗来使自身免疫性脑炎得到恢复，再给予康复的训练。通过康复训练，来恢复自身免疫性脑炎造成的功能障碍。
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