碳14呼气试验阳性，说明体内已经感染了幽门螺旋杆菌，感染后可以导致各种胃炎、胃溃疡、十二指肠炎、十二指肠溃疡，甚至胃癌的发生。因此，当其阳性时，应给予积极的根除治疗，主要的治疗方法为质子泵抑制剂、铋剂，联合两种抗生素的四联疗法，主要药物有阿莫西林、克拉霉素、埃索美拉唑以及果胶铋。治疗周期一般为7-14天，治疗后需要停药至少1个月的时间进行碳14呼气试验的复查。
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