影响结石形成的因素很多，遗传因素是其中之一，遗传可能不是主要致病因素，其它因素还包括患者年龄、性别、种族、环境因素，比如水质里含钙量、饮食习惯以及职业因素等，比如久坐职业、高温作业等，都是职业因素引起的结石。
形成泌尿系统结石的相对常见病因是身体代谢异常，比如肥胖症或者高脂血症人群容易得结石，可能和患者脂肪、糖代谢等因素有关。肾脏是排泄代谢废物的器官，由于某些大分子蛋白成分、电解质主要通过尿液排出，在排出过程中如果含量较高，电解质会析出形成结晶，以结晶为核心慢慢形成结石，这也是长结石的最主要原因，其它还包括尿路梗阻、泌尿系统感染等一系列因素。
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