盐酸小檗碱主要是可以用于肠道感染性疾病，对多数细菌只有微弱的抑菌作用，但是对痢疾杆菌、大肠杆菌具有比较好的抗菌作用，因此也主要是适合用于痢疾杆菌、大肠杆菌所引起的肠道感染性疾病，口服的不良反应比较少，偶尔可能会出现恶心、呕吐、皮疹和药物热，停药之后可以消失。这个药物对于妊娠前三个月的患者是要谨慎使用的，对于溶血性贫血以及葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏的患者也是要禁止使用的。除此之外，在用药的过程中如果出现了不良反应，应该及时就诊，总之盐酸小檗碱主要是可以用于肠道感染性的疾病。
