脑囊虫病的症状与囊肿的数量、大小以及感染的部位有关，根据包囊存在的位置不同，临床表现分为四种基本类型：
一、脑实质型，皮质的包囊可以出现全身或部分性的癫痫发作，可以出现偏瘫、感觉障碍、失语、小脑的包囊引起共济失调等等。
二、蛛网膜型，会引起脑膜刺激征、交通性脑积水和脑膜炎的表现。
三、脑室型，在第三、第四脑室的包囊，可以阻塞脑脊液循环，导致阻塞性脑积水，会出现颅内压增高的症状，比如头痛、眩晕、呕吐，甚至会突然出现意识障碍而死亡。
四、脊髓型，可以在颈胸段出现硬膜外的损害症状。
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