婴儿便秘的原因主要考虑是功能性消化不良所引起的，因为功能性消化不良，会造成婴儿消化道出现功能性下降以及菌落群失调现象。食物经胃部、肠道等消化器官组织分解吸收后，排泄物不能快速进入下消化道，从而造成患者出现有大便干结、排便不畅等不良症状表现。另外婴儿消化系统组织善未完全发育完全，一旦出现有饮食不当、营养不良等情况，由于调整能力相对较弱，其更为容易出现便秘的症状出现。但是也不排除其出现有乙状结肠扭转、大肠息肉、先天性肛门狭窄等其他疾病类型的可能性，若患者不良症状有持续或加剧情况，需要尽早到医院进行就诊治疗。
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