女性在来月经的时候发生疼痛，有可能与血清中的雌激素浓度变化有关系。由于女性的生理特点在月经的前后，血清中的雌二醇浓度会降低，这样就会引起颅内外血管以及子宫血管对某种因素，如5-羟色胺等物质更为敏感，从而引起血管张力的变化，使一部分对此敏感的女性而发生头痛。在月经以后，血清当中的雌二醇浓度恢复至正常，病人的头痛也会缓解。还有一种可能性存在，雌激素可以通过刺激泌乳素分泌，进而直接或间接的刺激前列腺素的分泌。而前列腺素作用于血管，会引起血管的收缩和扩张，这种变化由于雌激素的影响也呈现周期性的变化，从而激发头痛的发作。
