尽管打虫药的出现副作用的概率较低，但也不可以随便吃。打虫药的不良反应较多，如头疼、头昏、恶心呕吐、腹泻、口干、乏力，或者导致粒细胞、血小板减少，严重者甚至可能出现变态性脑炎，如出现意识障碍、反应迟钝、肢体瘫痪、失语、尿失禁等。
临床上打虫药主要用于肠道内的寄生虫，如蛔虫、绦虫、钩虫、蛲虫等，也可以用于肝内的寄生虫，如肝吸虫，以及脑组织内的寄生虫、血管淋巴管内的寄生虫、肌肉组织中的寄生虫等。根据寄生虫的种类、药物的适应症和禁忌症合理选择药物和疗程。一般驱虫药应该在清晨空腹时候服用，使药物充分接触虫体，以增加驱虫作用。如果怀疑体内有寄生虫感染，最好到医院就诊，在医生的诊断和指导下合理选择，正确使用打虫药。
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