腰椎间盘突出应该查核磁共振，核磁共振的成像原理主要是对病变组织水信号进行成像。腰椎间盘突出是退行性病变及造成的脊髓、神经的压迫，在核磁共振上会表现出明显的压迫的影像学，以及神经根是否出现水肿。同时，可以查清是否存在椎体终板炎的改变，所以应该更适合于核磁共振来检查。
CT主要是看组织的密度大小，比如骨骼密度和肌肉组织密度必然不同，通过影像学的密度差异来显示差别。一般的情况下，CT作为选择做腰椎间盘突出，成像上并不是很清晰，所以还是建议查核磁共振。
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