引起脑膜炎的病原体主要有病毒、细菌、结核、真菌、隐球菌、钩端螺旋体、寄生虫、梅毒、HIV-1感染等。
比如病毒性脑膜炎大多是由肠道病毒引起，肠道病毒主要经粪-口传播，大部分病人起初有肠道感染，肠道病毒与肠道细胞上的特殊受体结合。
病毒经肠道进入血液，产生病毒血症，经过脉络丛进入脑脊液，从而侵犯脑膜，引起脑膜炎症改变。
细菌感染一般是由肺部或其它脏器的感染波及到脑室和蛛网膜下腔系统，从而发生脑膜炎。
这些病原微生物累及到脑膜，临床上以发热、头痛、恶心、呕吐为主要表现，体格检查脑膜刺激征阳性。
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