短肠综合征是由于大量小肠切除或高位小肠造瘘后，缺乏足够的肠道组织，难以吸收足够的营养以维持生理代谢的需要，出现营养不良、水电解质紊乱、免疫功能下降，甚至器官功能衰退、消瘦、生长停滞等系列问题。在当前，短肠综合征病人的首选治疗是营养支持。
短肠综合征的表现一般分为3个阶段，失代偿期、代偿期和代偿后期。失代偿期是指大量小肠被切除后的早期,亦可称为第一阶段,剩下的肠道吸收面积有限，不但不能吸收水份和营养,而且连胃液、胆汁、胰液的分泌也不正常，所以患儿多表现为腹泻，因此出现水、电解质、酸碱紊乱，如果不及时进行液体治疗和营养支持，患儿会耗竭营养储备，失去代偿的时机。腹泻急性期可能会持续4～8周或更长时间，家长需给予足够的耐心。
患儿在住院期间，医护人员会以药物、静脉营养等手段减轻腹泻和维持水、电解质、酸碱平衡，患儿可慢慢过渡到代偿期，即小肠的吸收功能开始增强,肠液的丧失逐渐减少,肠黏膜出现增长。代偿期的时间与剩余肠道的长度和机体的代偿能力有关，短的数月，长的可达1～2年。小儿生长旺盛，可较成人代偿时间短。
当患儿可以开始肠内营养（即从胃肠道给予营养），并慢慢脱离静脉营养的依赖，此时医生、家长都不能操之过急，应选择容易吸收的肠内营养制剂，少量开始，慢慢增加，以刺激肠粘膜的生长。小婴儿特别是早产儿和部分吸收极差的患儿，可能需要通过胃管、营养管缓慢注入。由于肠管吸收面积大为减少，所以患儿对脂肪和完整蛋白质往往不能很好吸收，而出现脂肪泻（大便常规中出现未吸收的脂肪球）。乳糖不耐受引起的腹泻也时有出现。所以选择合适的肠内营养制剂，如含容易吸收脂肪（MCT）的水解蛋白制剂很重要。而且使用肠内营养剂的时间可能会比较长。
待肠内营养能很好适应后,请家长在医生的指导下，在肠内营养的基础上增加日常经口营养。首先进食高蛋白质、低脂肪和低渣少糖的膳食,如鱼肉、鸡蛋，少量多餐，具体安排视年龄和病情，并注意补充维生素、微量元素，大便量多时仍需补充口服补液盐。由肠内营养过渡到日常饮食同样需循序渐进，肠内营养制剂逐渐减量，日常膳食逐渐增加,直到完全食用普通膳食,但不可急于求成。有些患儿的消化、吸收功能代偿不完全，不能完全停用肠内营养制剂，维持几个月,甚至更长的时间。家长需对肠代偿的这个漫长过程有足够心理准备，不能同时改变饮食的品种和数量，如同时更换奶粉和添加辅食，否则又出现腹泻、失水情况，治疗又要重新开始。小婴儿应每周体重监测，定期到医院进行体格检查，并咨询临床医生及营养医生，接受正确的饮食指导。
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