心肌再灌注，主要是指心肌缺血后的再灌注损伤，它是由于冠状动脉的一部分或者全部出现急性闭塞性疾病之后，在一定的时间内又重新获得血管的再通，已经缺血的心肌细胞虽然得到恢复正常的血流灌注，但是心肌组织的损伤是一种进行性加重，这种病理过程叫做心肌缺血再灌注损伤。
缺血之后容易引起心脏能量代谢、心脏功能、心脏电生理以及心肌细胞超微结构，这些系统的变化在再灌注之后表现得更为突出，严重时可以发生致命性的心律失常。一部分的冠状动脉搭桥术、溶栓术，或者心肌梗塞之后建立一定的侧支循环，都可以出现心肌缺血后的再灌注损伤，这种损伤主要通过白细胞的炎症以及钙离子的超负荷作用，除心脏以外缺血再灌注损伤还能见于其他的脏器，比如肝脏、肾脏、肺脏或者胃肠道。
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