输尿管结石复杂多变，结石性质、形态、大小、部位不同以及患者存在个体差异等因素，治疗方法的选择也不相同，少数能找到病因者，首先采取对因治疗。
结石＜0.6cm，表面光滑，结石以下尿路无梗阻时，采用药物排石治疗；直径＜2cm的输尿管上段结石，可采用体外冲击波碎石；泌尿系平片不显影的中下段输尿管结石或者因肥胖、结石硬度大、停留时间长导致体外冲击波碎石困难者，以及体外冲击波碎石造成石阶者，适用输尿管镜取石术；部分较大输尿管上段结石，采用经皮肾镜碎石取石术；输尿管结石＞2cm，其它治疗失败者，可考虑腹腔镜输尿管取石术，但一般不作为首选方案。
以上治疗方法比较普及，大多数输尿管结石已不再行开放性手术治疗，仅用于少数特殊情况的患者。总之，对待输尿管结石的治疗，必须实施个体化方案，有时需要多种方法综合治疗。
