孕酮一般情况下在卵泡期和经期处于一个非常低的水平。当女性排卵以后卵巢上会产生一个临时性的器官叫黄体，黄体是卵泡的继续，就是当一个成熟卵泡破裂以后就会形成黄体。黄体会产生黄体酮，也就是孕酮，即孕激素。当卵泡发育不好或黄体发育不好时，会造成孕激素分泌不足。孕激素分泌不足时给患者测血孕激素就会低。
所以，孕激素低很可能是女性卵泡发育不正常或者是排卵以后黄体发育不良。卵泡发育会排出卵子，卵子和精子结合才能怀孕。卵泡发育不良，卵子质量差就会造成精卵结合障碍，这种情况下容易造成不孕症。黄体分泌的孕激素能够维持妊娠的继续，当孕激素分泌过低时，不能使妊娠继续，这种情况下会造成早期的流产或生化妊娠，也会造成女性不孕症。
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