在发生急性鼻窦炎时，需要使用抗菌素积极控制感染，头孢菌素类可以作为首选，以第二代头孢类效果最佳，比如头孢呋辛，一般使用的周期在3-5天，即使症状明显得到改善，也可以坚持用药2天左右，主要是为了彻底的治疗。慢性鼻窦炎往往是由于急性鼻窦炎治疗不彻底，慢慢迁移而成的，同时需要使用黏液促排剂，使脓液顺利流出，以及短期的鼻腔血管收缩剂，促进鼻腔的空间扩大，促进鼻窦的通气引流。慢性鼻窦炎使用抗菌素的周期一般在1周左右，主要是减轻局部的炎症反应，使术中减少出血，有利于手术做得更加彻底。手术以后也可以适当的使用头孢菌素1周左右，主要是减轻黏膜的水肿，预防肿胀导致窦口的再次堵塞。
