质子刀治疗脊索瘤具有一定的优势。因为目前认为单独质子束治疗或者与高能量X线联合治疗脊索瘤，比常规放射治疗更为有效。但是，质子束治疗需要少数有回旋加速器的单位实施，在实际操作中由于需要采用阶梯疗法，通常大约七周时间，很多单位难以实施。如果自身有条件，可以考虑进行质子刀治疗。对于脊索瘤体早期主要的治疗方法，为手术全切辅以放射治疗。因为脊索瘤具有一定的恶性率，很容易发生复发，平均生存期大约是6.3年左右。质子刀治疗脊索瘤可能有相对较好的疗效，可以考虑采用。
