肿瘤标志物高不一定是癌症，但是要排除是癌症的情况，特别是某些肿瘤标志物，如甲胎蛋白明显升高400ng/mL，如果同时有B超、CT、磁共振发现有肝脏肝性病变，考虑原发性肝癌的诊断。
其他的肿瘤标志物如癌胚抗原、CA19-9等，只能起到提示诊断的作用，并不能起到决定的诊断。肿瘤标志物只能参考，而肿瘤的诊断一定需要病理，也就是说在组织当中找到癌细胞才能确诊是癌症的情况，如肺癌、结直肠癌、胰腺癌等。当然原发性肝癌的诊断可以不需要病理诊断，其他的如卵巢癌、宫颈癌等，虽然肿瘤标志物可以明显升高，但是都只能起到提示诊断，一定需要病理进一步证实。
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