经常腹泻多和慢性肠炎，或者是菌群失调有关，不过也有可能是慢性肝炎、肝硬化等疾病。一些细菌感染所致的肠炎，如果治疗不及时，可以导致肠道耐药菌株的产生，引起慢性肠炎，并进一步导致肠道的吸收能力下降，诱发反复腹泻。经常应用抗生素，则可以导致肠道菌群紊乱，人体摄入的食物，有许多需要在益生菌的作用下，才能被分解吸收，如果益生菌被抑制，会导致食物消化障碍，诱发腹泻。慢性肝炎、肝硬化，可以导致胆汁分泌障碍，而脂肪类食物的消化和吸收需要胆汁的参与，有慢性肝炎、肝硬化的时候，在进食脂肪类食品后容易有腹泻，称为脂肪泻。另外，如果平时衣物单薄，还要排除腹部受寒所致，肠道受到寒冷刺激可以加快蠕动，导致食物的吸收消化时间缩短，也会引起腹泻。
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