一般治疗和药物治疗后的便秘效果欠佳，并经过便秘特殊的检查显示有明显异常，才可以考虑手术治疗，但是，应该慎重掌握手术的适应症，并针对病变选择相应的手术方法。如果有多种病变同时存在，应该用手术解决引起便秘的主要病变，术前也需预测疗效，该注意有没有严重心理障碍以及结肠以外的消化道异常。术后并发症比较常见，包括小肠梗阻，有大约1/3的患者都有可能出现，另外腹泻、大便失禁以及便秘复发等也可能出现。尽管排便频率经过手术可能会获得改善，但其他症状，包括腹胀、腹痛并没有明显改善，因此，结肠切除术加上回肠-结肠吻合术，仅仅只用于非手术方法无效，且胃和小肠运动功能正常的患者。
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