扁桃体结石是由于长期阻塞和引流不畅导致的，干酪物样聚集或不易溶解的钙镁等无机盐沉积而形成结石，其核心多为小异物或脱落的上皮细胞或细菌等。所以要想自愈可能性较小，且每天进食食物的残渣也容易腐烂变硬，形成结石，口服高血压药物、止痛药和抗抑郁药的患者也容易造成扁桃体结石。随着年龄增大，扁桃体表面凹凸不平，也导致了食物更容易残留在里面形成结石。小的结石可以及时的在门诊将其取出，较大的结石必要时需进行局部的切除手术。
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