Barrett食管经过多长时间发生癌变，不是能够确定的数字。Barrett食管的癌变可能需要经过几年、十几年，甚至几十年，也可能终生不会发生癌变。Barrett食管发生癌变的几率是5%-20%，是一般人发生癌变的30-125倍。
Barrett食管癌变要经过上皮化生、移行性改变，然后经过食管黏膜上皮的非典型增生发展成食管腺癌。原发性食道腺癌中50%来自于Barrett食管，所以Barrett食管是一种癌前病变，应该早期发现、早期治疗，预防癌变。Barrett食管的病人应该坚持定期随访，每年进行胃镜检查，早期发现细胞的移行增生和早期癌变，给予相应的手术治疗。
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