肛周脓肿不是肛瘘，它们在疾病的表现上不是一类疾病，但肛瘘可以是肛周脓肿的延续，肛周脓肿也可以因为肛瘘诱发。
肛周脓肿是肛门周围软组织的一种化脓性感染疾病，肛门周围组织疏松，在一些特定情况下，例如内痔、肛瘘等，因为肠道细菌感染，如大肠埃希菌，可以引起化脓性感染，形成肛周脓肿。
如果脓肿向直肠及肛管内穿透，在愈合后形成一个窦道，导致直肠与肛管和外界相通，就会形成肛瘘。
