做体外冲击波碎石时，病人需要取平仰卧位，需要暴露碎石部位皮肤，在冲击波水囊上涂上凝胶，然后调整机器让水囊对准结石。通过X线定位将结石通过交叉定位，定位于冲击波探头之下，调整能量开始碎石。
嘱病人尽量减少呼吸运动，可以准确的将结石通过冲击波碎石击碎。冲击波通常碰到较大介质改变时才会释放能量，所以对皮肤及组织器官没有损害。当碰到介质变化较大的结石时，才会释放能量将结石瞬间打碎。然后通过口服药物辅助排石，通过大量喝水将结石排出。
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