肝脏并发症(VOD)
通常表现为：肝肿大(肝痛)、腹水、体重增加超过基础体重5％。次并发症不多见。
出血性膀胱炎
出血性膀胱炎的潜在危险因素很多，包括aGVHD、无关供体移植、特定预处理方案(含有环磷酰胺、异环、马法兰等)、感染性因素(如BK病毒、腺病毒、CMV及JC病毒)等。通常表现为小便次数增多，尿不尽感即排便不畅，严重者有尿痛和肉眼血尿。
因此移植后病人要多饮水，间断输注静脉丙球提高免疫功能，还可以用一些抗病毒药物。
AIDS相关NHL：绝大多数是高度进展和高度恶性的B细胞淋巴瘤，细胞类型多为小无裂细胞型，大细胞和免疫母细胞型。包括原发中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL)和系统性淋巴瘤，后者病理组织学分成4类，包括：Burkitt和非典型Burkitt淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、免疫母细胞淋巴瘤(伴浆细胞样分化)和原发性渗出性淋巴瘤(PEL)。
移植物抗宿主病(即排异)
皮肤排斥表现为皮肤瘙痒、皮疹;最多的部位是手心和足底
肝脏排斥有黄疸、肝功能异常
肠道排斥有腹痛和腹泻
急性排斥出现在三个月内，慢性排斥出现在三个月后。
移植后患者要注意是否有上述症状发生，另外不洁饮食可以诱发肠道排斥。要遵从医生服药。
各种机会感染
移植后免疫功能低下，需要一年左右逐步恢复，因次这一年中要特别小心，避免到公共场所，避免接触感冒家属和亲戚，建议这一年中拒绝朋友和亲属的访视，口服一些预防感染药物，一旦发热立即就诊。
