手指甲癣的病因是局部指甲真菌感染，感染部位是指甲或者甲下组织，引起甲癣的真菌种类繁多，常见的有红色毛癣菌，须癣毛癣菌，絮状表皮癣菌等。
身体其他部位的真菌感染也可以感染手指甲，引起甲癣，如股癣，脚癣等等。
另外，平时身体抵抗力差，贫血，指甲营养不良等情况会增加甲癣的发病几率。
确诊甲癣后应该积极药物抗真菌治疗。
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