确诊新型冠状病毒肺炎，要结合流行病学史和临床表现以及病原学诊断综合分析。如果有流行病学史，例如在14天内有社区报告旅行史或居住史，以及与患者或无症状感染者有密切接触史，甚至是来自病例报告社区的发热或呼吸道患者，有聚集性发病等情况，同时出现两例以及有发热或呼吸道症状时，属于有流行病学史。需要同时满足有发热或者呼吸道症状，或者是有肺炎典型表现，以及血象白细胞正常或降低，淋巴细胞正常或减少中任何两条。
此外，确诊需要有核酸检测呈阳性，或者是新冠病毒特异性IgM、IgG呈现阳性。如果没有流行病学史患者，要有发热和呼吸道症状，同时有新冠肺炎影像学特点，和血常规、白细胞正常或降低，淋巴细胞正常或减少，同时有核酸检测阳性或特异性抗体呈现阳性，也可以确诊为新型冠状病毒肺炎。
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