脑脊液检查本身是没有什么痛苦的，但是在采取脑脊液化验之前，必须要做腰椎穿刺术。腰椎穿刺术实质上是一种临床操作，让患者采取侧卧位，通常在第3腰椎和第4腰椎椎间隙之间，用腰椎穿刺针进行穿刺。在穿刺以前会做局部麻醉，因此患者通常是没有什么痛苦的，做完腰椎穿刺以后需要平卧6-8个小时，这个可能有一点难受，但是并不对患者造成任何伤害。如果患者做的不是腰椎穿刺术，而是腰大池引流手术或者是侧脑室穿刺手术。这种情况下就会对患者造成一定程度的痛苦，因为损伤和穿刺比较大，并且要在人体身上留置引流管，需要保留1个星期左右。
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