质子治疗脊索瘤比单独常规放疗可能更为有效。因为脊索瘤对于一般的放疗不是非常敏感，虽然目前推荐脊索瘤的治疗方法为手术切除辅以放射治疗，但是，质子束疗法可能更为有效。但是，质子束治疗需要到少数有回旋加速器的单位实施，由于所采用的阶梯疗法通常大约需要七周左右时间，因此可能难以安排。如果有条件用质子束治疗脊索瘤，可以考虑选用该方案。由于脊索瘤患者平均寿命大约为6.3年左右，对于没有经过任何治疗的脊索瘤患者，寿命不会超过2年，因此，对于脊索瘤的治疗需要采取积极可行的治疗方案，这样才能提高患者的生存率。
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