原发性肝癌的预防主要是从导致肝癌的病因进行，由于大多数肝癌患者合并乙肝和病毒感染，因此对于健康人群，特别是新生儿、青少年要接种乙肝疫苗，以避免乙肝病毒感染，这样就可大大减少肝癌的发生。对于已经感染乙肝或者丙肝的人群，要通过定期监测以期早期发现包括慢性肝炎或者肝硬化的情况，在出现肝脏受损之前进行抗病毒治疗，可以降低肝癌的发生。同时肝癌的出现和日常生活习惯，特别是长期饮酒、某些不良的习惯，包括熬夜或者进食伤害肝脏的食物，还有被黄曲霉毒素污染的水和食物有关，减少肝脏致病因素也可大大降低肝癌的发生。
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