一、遗传因素：
1、即亲属患病率随群体患病率的增高而增高，亲属关系愈密切，患病率愈高，男性患病率高于女性,通常男性患者的子女仅有唇裂，但女性患者的子女较易同时发生唇裂与腭裂；患者病情愈重，则其亲属患病率愈高，随着已有患儿数目的增加，以后再出生子女的唇腭裂患病率不断增加。
2、近亲婚配较正常人高50％-100％
3、种族特点黑种人0.4％，白种人1％，日本人更高为3％。
二、环境因素：
1、营养因素动物实验母鼠食物中缺乏维生素B、A、E时，其幼鼠常发生唇腭裂的畸形。
2、内分泌影响小鼠孕期的第13-15天内各注射一定剂量的地塞米松，其所生的幼鼠中有82％出现腭裂。
3、药物因素的影响服用四环素、水杨酸类、抗癫痫药、抗麻风类药、安眠药、反应停等的孕妇，长期接触农药妇女，易于使胎儿发生唇腭裂。
4、生物因素怀孕前3个月内感染病毒(如风疹)，可诱发婴儿唇腭裂。
5、损伤和精神损伤不全流产可损伤胚胎，直接地影响胎儿的发育精神刺激可促使体内肾上腺皮质激素的分泌增加，在动物实验中注射肾上腺皮质激素可以诱发幼鼠腭裂。
6、物理性因素放射线、微波婴儿可发生唇腭裂等畸形。
7、烟酒的影响吸烟、饮酒的孕妇，婴儿唇腭裂的发生率较高。
