胆道闭锁患儿肝功能异常，且长期使用激素，接种减毒活疫苗后可能导致疫苗菌在体内长期繁殖，危害患儿身体健康，故不能接种，此类疫苗包括：卡介苗、脊髓灰质炎疫苗、麻腮风疫苗。
胆道闭锁患儿如术后肝功能恢复正常，饮食良好，可选择性接种灭活疫苗（百日咳）和亚组分疫苗（乙肝、乙脑、流脑、白喉、破伤风疫苗），有严重器质性疾病者，如严重的肝脏、肺脏、肾脏等疾病则需要暂缓接种。郑州大学一附院小儿外科岳铭
