先天性癫痫在治疗方面主要是选择药物治疗，根据癫痫发作的类型选择有效的药物，例如小儿失神发作可以选择乙琥胺，对于复杂的运动性的发作，可以给予丙戊酸钠进行口服。先天性癫痫的患者也主张在饮食方面要营养化，不能喝刺激性的饮料以及辛辣刺激性的食品以及咖啡、浓茶等；另外要多给生酮饮食，生酮饮食也就是说高脂肪、低碳水化合物的饮食。先天性癫痫在心理上不要让患儿有抑郁的情绪要保持乐观。
