FMT是一种通过重建正常肠道微生态结构治疗疾病的方法，全名叫做肠菌移植。即提取出健康人的肠道菌液，通过鼻肠管或胃肠镜方式导入到患者肠道内，利用健康者肠道中有益菌群来治疗疾病。作为近年来新兴的一项技术，FMT在多种疾病，尤其是慢性难治性疾病中取得了突破性进展。
什么病适合FMT治疗?
目前FMT治疗疾病包括：肠易激综合征、溃疡性结肠炎、克罗恩病、抗生素相关性腹泻、慢性难治性便秘、脂肪肝、慢性乙型肝炎、肝硬化、艰难梭状杆菌感染、自闭症等。
FMT治疗优点是什么?
1、疗效确切，对于慢性难治性疾病，即药物治疗或其他治疗效果无效者，有较高的有效率。
2、副作用少，目前尚未见FMT严重并发症的报道，未见特殊不良反应。
3、疗程短，多数疾病治疗1-3次即可，少数慢性难治性疾病可酌情增加疗程。
4、复发率低，相比药物治疗，疗效确切，复发率低。
FDA将对粪菌移植进行规范
近来有很多研究表明，通过粪菌移植能够治疗耐药性难辨梭状芽孢杆菌(艰难梭菌)感染。这些研究者如果要继续进行相关探索或许需要获得美国食品药品管理局(FDA)的许可。FDA 表示，粪菌符合生物制品的定义，而这类产品用于人体检测之前需要获批临床研究申请(IND)。FDA 发言人艾伦 5 月 15 日告诉 MedPage 说，FDA 还未发布有关粪菌移植的新规则，正在实施粪菌移植的医师如果想继续使用这种治疗方式，那他们需要一份临床研究申请。FDA 表示，在紧急情况下，研究人员可以通过电话或者其它快速的通信手段申请使用粪菌移植，对此 FDA 可以迅速做出回应。但在非紧急情况下，对个别患者使用粪菌移植之前，临床研究申请必需由 FDA 进行审查。 许多研究者和临床医生希望这种规则会对其临床实践和研究产生明显的影响。休斯顿德克萨斯大学医学中心的医学博士 Herbert DuPont 正在准备一项重要的粪菌移植计划，他表示其研究方案已获得该中心机构审查委员会 (IRB) 的批准。DuPont 告诉 MedPage Today 说，“我感到失望吗?是的，我对结果有疑问吗?绝对没有。”DuPont 也参加了听证会，他对 FDA 因担忧粪菌移植等程序的安全性和有效性而去设置标准表示理解。范德堡大学的传染病专家及医学博士学威廉? 沙夫纳表示，临床研究申请的要求可能会增加研究者的经济负担。威廉? 沙夫纳告诉 MedPage Today 说，“仅编制一份临床研究申请，然后去实施，并管理数据达到 FDA 所要求的复杂水平，这些就需要花费一大笔资金。”FDA 的艾伦表示他当下还不清楚临床研究申请的费用。FDA 表示，临床研究申请的目的是确保患者不暴露于任何“不合理的风险”。但 FDA也指出，规范粪菌移植程序与任何不良事件无关。
