婴儿两病筛查是筛查苯丙酮尿症和先天性甲状腺功能低下症。先天性甲状腺功能低下症，是由于甲状腺激素T3、T4产生不足引起新生儿智力低下和体格发育落后的内分泌疾病。苯丙酮尿症是一种苯丙氨酸代谢异常的先天性疾病，智力低下是此病的突出特点。这两种疾病都属于先天性疾病，是少数可以早期诊断和治疗的先天性疾病。如果这两种疾病未及时诊断和治疗会造成严重的后果，因此国家要求对婴儿进行两病筛查。
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