孕酮低与胎停育的关系比较密切，两者互为因果关系。孕酮低是胎停育造成的结果，胎停育不是因为孕酮低导致，胎停育主要是胚胎质量不好或者胚胎染色体异常，或者母体有疾病等导致。胎停育后分泌的孕酮减少，孕酮低只是结果，是一种表现形式，如果胎停育后导致孕酮低，即使再补充黄体酮也不会改变妊娠结局。这种怀孕状况下，一般是刚开始查孕酮正常，随着胚胎发育逐渐不好，分泌孕酮逐渐减少孕酮值低下，即使补充了黄体酮，也不会改变胎停育的结局。
孕酮低是胎停育的原因，黄体合成的孕酮是唯一天然来源的孕激素，孕酮随着孕周增加而增加，如果体内孕酮含量明显降低，不能维持胚胎或者胎儿的生长发育，会造成胎停育的发生。最常见的孕酮低导致胚胎停育的原因就是黄体功能不全，在怀孕期间由于黄体功能不全导致孕酮分泌量减少，容易引起孕酮发育迟缓。建议孕妇在孕检过程中需要注意孕酮的检测，一旦出现孕酮降低的表现，需要在医生的指导下选择黄体酮类药物进行保胎治疗。这种怀孕状况下由于黄体功能不全，一般是从第一次检查开始孕酮值就低下，立即给予黄体酮保胎治疗，可能会有一定的疗效。
