目前大部分胸外科手术都是通过胸腔镜来完成，肺切除术时，在胸腔镜辅助下，医生通过手术器械去游离病变部位肺叶或者肺段血管、气管，确认病变部位无误后，进行腔镜下特殊器械离断，将病变所在肺叶或者肺段组织切取送病理。病理现在有快速术中冰冻，大概30分钟就可以出结果。
如果病变为原位癌或者微浸润癌，到目前为止还没有发现淋巴结转移，可以做局部淋巴结采样，甚至不需要再清扫淋巴结，手术就完整结束。如果病理报浸润性肺癌，必须再进行严格和系统的周围淋巴结清扫，清点器械纱布无误，确认没有活动性出血之后，逐层关胸。
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