牙齿如果形成了结石，对邻近的牙龈和牙槽骨都有一定的刺激，使它们发生萎缩和吸收形成牙周袋。牙齿表面本身没有牙石，但是进食以后会有食物残渣积存在牙颈部，如果没有及时进行刷牙把食物参加清理掉，食物残渣就会慢慢沉积形成软垢，软垢可以发生钙化形成牙石。牙石上可以附着一些细菌，有的细菌是引起牙周病的细菌，这些细菌可以分泌毒素，这些毒素会刺激牙槽骨形成破骨细胞，破骨细胞会吞噬牙槽骨使得牙槽骨发生萎缩、吸收。牙槽骨萎缩了高度降低，牙龈也会发生萎缩，形成牙根部分暴露医学上称为牙周病，有的牙石对牙龈也会有机械刺激，会引起牙龈的炎症和退缩。
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